应该说多数卵巢囊肿是不影响生育的，如果不体检或不作B超等检查根本就不会发现它。卵巢囊肿是否影响生育取决于囊肿的性质、大小及位置，如单纯囊肿，且不太大，通常不影响生育，亦无需处理。
如囊肿较大或双侧，有可能妨碍输卵管的输卵，故可影响受孕，此种可考虑手术剥除，但应注意到术后粘连亦可致不育，故术前应权衡其对生育的影响，最后经过一定时间的观察和治疗再决定手术。如为巧克力囊肿，可按巧克力囊肿处理，必要时可行腹腔镜下手术或开刀手术，其怀孕率在50%~70%之间。总之，卵巢囊肿影响生育但并非一定不育，经适当治疗后可提高其受孕机会。不清楚你是患的何种囊肿，你可以根据上述自行判断或找医生咨询。
诊断与治疗
有些卵巢囊肿可在例常妇科骨盆检查时发现。有些可通过超声波扫瞄发现。由于皮状囊肿里含有骨头与牙齿等硬物，X-光探测偶尔能现发这类囊肿。一旦发现囊肿，为了诊断是否属于癌症，可用超声波扫瞄探测囊肿里是否只含液体或含有液体和固体的混合物。混合体是癌细胞存在的症兆。如果是功能性囊肿，再度检查时囊肿可能缩小或消失。如果囊肿没有消失或反而变得疼痛、增大，就有必要作CA125血清检测。
所以如果发现卵巢囊肿3个月没有减小的迹象，无论有无明确检查出有癌变都要尽快行相应的治疗。
浆液状囊肿、黏液状囊肿及没有痛经和生育要求的巧克力囊肿可以行介入治疗。
皮状囊肿和有痛经及生育要求的巧克力囊肿可以行腹腔镜(laparoscopy)摘除囊肿和祛除子宫内膜异位。
