有很多人担心接种HPV疫苗会影响生育能力，但最近发表于Pediatrics（《儿科学》）杂志的最新研究表明，HPV疫苗接种不会影响少女未来的生育能力。
虽然有媒体报道称，HPV疫苗接种后使得过早绝经（原发性卵巢功能不全），但这些案例是根据少数个别个案编写的，需谨慎对待。
该研究对近20万名年轻女性进行了研究，发现在HPV或其他推荐的疫苗接种后，原发性卵巢功能不全的风险并没有增加。
在接受HPV疫苗接种的近5.9万名年轻女性中，只有1人后来出现了原发性卵巢功能不全。
如果原发性卵巢功能不全是由HPV或其他推荐的青少年疫苗引发的，预期应该在接种疫苗的年轻女性中出现更高的发病率，但结果并没有出现类似风险的升高。
疫苗的安全性已得到确认，该研究提供了重要的基于人群的科学证据，证明了HPV和其他青少年疫苗并不会对年轻女性的生育能力产生负面影响。
美国疾病预防与控制中心指出，所有11~12岁男孩女孩都应该接种HPV疫苗，9岁就可以开始接种系列疫苗。年幼的时候没有接种的青少年仍需接种。建议26岁及以下女性和21岁及以下男性接种HPV疫苗。如果以下人群在年轻时未接种疫苗，建议接种：
•与男性发生性关系的青年男子，包括自认为是同性恋或双性恋或打算与男性发生性关系的26及以下男性；
•26岁前变性的年轻人；
•26岁前患有某些免疫缺陷疾病（比如艾滋病）的年轻人。
2006年起，美国官方建议接种HPV疫苗采用6个月以上三个剂量系列注射。2015年，官方将这一建议改为在15岁之前开始接种两剂，第二次注射HPV疫苗应在第一次注射后6~12个月。间隔不到五个月接受两剂疫苗的青少年需要注射第三剂HPV疫苗。
从15~26岁开始接种HPV疫苗的年轻人仍需要三剂HPV疫苗。
HPV疫苗也有一些副作用，最常见的副作用通常是轻微的，包括：
注射侧手臂疼痛，注射部位发红、肿胀；
•发烧
•头痛或感到疲惫
•恶心
•肌肉或关节疼痛
美国疾病预防与控制中心表示，没有数据表明接种HPV会影响女性未来的生育能力，事实上，接种疫苗、预防与HPV相关的癌症能够帮助女性和家庭拥有健康的妊娠和孩子。
