抗生素的害处可能还有导致儿童肥胖。最近发表于《消化道》（Gut）杂志的一项研究表明，在两岁前服用抗生素的婴儿更有可能变肥胖。胃酸反流药物也可能增加儿童肥胖风险。
至于为什么会出现这种联系，研究人员推测这可能与此类药物对生长中的儿童肠道脆弱的微生物环境的影响有关。
该结论是通过对婴儿用药史和8岁以上儿童肥胖发生率进行跟踪调查后得出的。研究跟踪了出生于2006~2013年间大约33万的儿童，超过24万儿童在2岁前服用过抗生素。将近四万人服用过组胺阻滞剂，超过1万人服用质子泵抑制剂，近6000名儿童服用过三种药物。
根据2岁~8岁期间儿科医生就诊记录，研究人员发现将近五万（14%）的儿童变成肥胖。其中约有9600人在婴儿时期从未服用过抗生素或反酸药物。
在将用药史与肥胖症发病率进行比对后，研究人员得出结论：使用抗生素的婴儿在3岁前患儿童肥胖症的风险要高出26%。婴儿服用抗生素的时间越长，风险就越高。
虽然这只是一项观察性研究，但该结论对父母有一定的借鉴意义。确保孩子服用他们需要的药物，而非没有必要的。
例如，胃酸反流药物，如组胺阻滞剂和质子泵抑制剂，通常是在没有明确指示的时候就给婴儿服用。胃酸反流在婴儿中是正常现象，并不一定要服用胃酸反流药物。大多数婴儿在一周岁的时候就会摆脱这个问题。
另一方面，抗生素在治疗感染方面确实发挥着重要作用，不应该因为担心肥胖而在必要的时候不使用抗生素治疗。
美国西北大学范伯格医学院儿童健康研究高级科学家Ruchi Gupta称，这些发现很有趣，因为它们提出了抗生素和药物等因素会改变肠道菌群，并影响儿童的健康状况。不过目前这些发现只是重要的关联，还需更多研究探索真正的因果关系，因为它受多环境行为的复杂影响。
