种地要施肥，施肥能增产是个普通的道理，但是也不能一味增加施肥量或单纯依赖化学肥料。
合理施肥能够使植株生长健壮，发育正常，也就意味着植物的遗传潜能，包括抗病性得以正常表达。所以，一切有利于植物正常生长的栽培管理措施，包括施肥，都有助于防病。健身栽培也就成了防治多种病害的根本措施。
众所周知，严重缺肥或施肥过量都会导致生理病害，称做缺素症或肥害。多数情况下，不适当的施肥可能没有造成明显的不正常，但可能降低植物的抗病性。稻瘟病、纹枯病、小麦白粉病、烟草赤星病等通常被称为高肥病害，这里，“高肥”实际上指的是氮素肥料。氮肥施用过多、过迟或过分集中，常引起稻株疯长，叶片软弱下披，体内氨态氮和游离氨基酸含量过高，碳氮比值降低，最终削弱了水稻的抗病性。氮肥过多还会造成植株郁闭、结露时间长，为真菌病害提供适宜侵染的环境条件；相反，水稻胡麻斑病、苹果树腐烂病、小麦根腐病、茄科植物早疫病、青枯病，以及大多数植物幼苗上经常发生的猝倒病，则常在缺肥的田块发生严重。1943年印度孟加拉邦的水稻胡麻斑病大流行，导致著名的孟加拉大饥荒，干旱和缺肥是重要原因。
在一般情况下，增施磷、钾肥可以改善植物体内营养的平衡和促进作物成熟，从而避开侵染幼嫩组织的病菌，增强抗（耐）病性。特别是针对局部侵染植物根、茎和叶片组织的真菌病害，如小麦秆锈病、大麦全蚀病、马铃薯疮痂病、番茄早疫病、玉米茎腐病等。但磷过量可能加重菠菜病毒病和小麦颖枯病，钾过量可能加重稻瘟病和根结线虫病的危害。
在一些地区，由于长期过分地依赖化学肥料，一些农田的有机质含量明显下降，加上大量使用化学药剂，土壤微生物种贫乏，抑制土传病害的能力下降，这是近年许多作物的枯萎病、纹枯病、根腐病、线虫病上升的主要原因。使用腐熟有机肥和菌肥无疑会增加土壤微生物种类和数量，是减轻或抑制土传病害的治本措施。当然，也要强调有机肥的腐熟，否则施肥也能传播病虫和草籽。
