俗称农家肥，主要来源于植物和（或）动物，施于土壤以提供植物营养为其主要功能的含碳物料。经生物物质、动植物废弃物、植物残体加工而来，消除了其中的有毒有害物质，富含大量有益物质，包括：多种有机酸、肽类以及包括氮、磷、钾在内的丰富的营养元素。不仅能为农作物提供全面营养，而且肥效长，可增加和更新土壤有机质，促进微生物繁殖，改善土壤的理化性质和生物活性，是绿色食品生产的主要养分。
有机肥原料只有通过正确的发酵腐熟后方能发挥其最大肥效，在堆沤未腐熟的有机肥时，堆肥场地要选在背风、向阳、地势高燥的地方，在堆肥地面铺农膜或选水泥地面，要将农家肥中的畜粪结块打碎，秸秆要铡碎在5厘米以下进行碾压，并要混入约3％左右的过磷酸钙和粪土翻匀后进行堆积。加入过磷酸钙主要是防止有机肥中的氮素流失，并能增加微生物的活动。堆制好后把表面用铁锨拍平，用泥抹10厘米左右厚或用农膜覆盖，四周压严，制造缺氧环境，使之尽快腐熟。农家肥堆60天左右即可腐熟。
各种粪便如果不经过发酵腐熟处理会有很多危害:
1、传染病虫害。粪便、生活垃圾等有机物料中含有大肠菌、线虫等病菌和害虫，直接使用会导致病虫害的传播、作物发病，对食用农产品的人体健康也产生影响;未腐熟有机物料在土壤中发酵时，容易滋生病菌与虫害，也导致植物病虫害的发生。
2、酵烧苗。不发酵的生粪等有机物料施到地里后，当发酵条件具备时，在微生物的活动下发酵，当发酵部位距根部较近且作物植株较小时，发酵产生的热量会影响作物生长，严重时导致植株死亡。
3、毒气危害。在分解过程中产生甲烷、氨等有害气体，使土壤和作物产生酸害和根系损伤。
4、土壤缺氧。有机质在分解过程中消耗土壤中的氧气，使土壤暂时性的处于缺氧状态，会使作物生长受到抑制。
5、肥效缓慢。未发酵腐熟的有机肥料中养分多为有机态或缓效态，不能被作物直接吸收利用，只有分解转化成速效态才能被作物吸收利用，所以未发酵有机肥直接施用时使肥效减慢。
6、未经处理直接使用，有机物料体积大，有效成分低，运输不便，使用成本提高。
