贮藏用的莲藕，应严格挑选无病伤，质地坚实，藕肉肥厚，含水量少的地下茎，采收时不洗涤，表面带泥整支贮藏。方法有三:
一是用砖或板条箱或木板等封围而成埋藏坑，然后一层莲藕一层泥土，堆5～6层后，再覆盖10厘米厚的细泥（细泥应细软带潮，手捏不成团，并去掉碎石等杂物）。埋藏时，莲藕要按顺序一排排放齐，避免折断。
二是用有水泥地板的房屋埋藏，坑底需先用木板或竹架垫起10厘米厚，形成一个隔底，再铺一层10厘米厚细泥土，再按上法堆码覆土。贮藏室每隔15天消毒1次。
三是利用室外露地埋藏，选择地势高而背阳避光的地方，将泥、藕相间层层堆成斜坡式或宝塔形，用泥全部覆盖种藕，周围挖好排水沟防积水，遇雨天应及时遮盖。上述方法贮藏中应每隔20～30天翻桩检查1次。
