青花菜采后经挑选、修整及保鲜处理后应立即进入预冷库预冷。防止青花菜变色、变老和延长保鲜期最关键的措施是采收后尽快置于低温条件下。在室温下1～2天花蕾花茎就会失绿转黄，故最好能在3～6小时内降至1～2℃，通过-17℃低温快速预冷的方法可在5小时内使菜温降至要求低温。青花菜的包装可直接用聚苯乙烯泡沫箱，装箱后立即加盖入库，或外包装用打蜡纸箱，内包装用0.03毫米厚的聚乙烯薄膜单花球包装，必要时在袋上打2个小孔，能取到良好的自发气调作用。用聚乙烯袋密封加硅橡胶窗即硅窗法作内包装，能控制二氧化碳含量在5%～10%，贮藏效果更佳。
青花菜的最适贮藏温度为0～1℃，相对湿度为90%～95%，在此环境条件下结合上述包装可贮藏30多天。青花菜的运输也要求用冷藏车，但温度不宜高于4.5℃，否则小花蕾会很快黄化。对于没有冷藏设备条件贮运的，可于采收后及时在包装箱内加冰块降温，加冰量占箱总体积的1/3～2/5，并尽快运至目的地。
青花菜在贮藏期间有一定量的乙烯释放出，这种气体在贮藏环境中积累起来，会加速花蕾衰老变化，贮藏管理上应注意适时通风换气。
