青枯病是番茄的重要病害，苗期一般不表现症状，到开花坐果时开始发病。番茄青枯病菌在微酸性土壤、高温高湿、连作、地势低洼、排水不良、缺钾肥以及根部损伤等条件下，该病容易发生。实践证明，通过采用优选品种、轮作嫁接、加强栽培管理、清除病源、药剂防治等综合防治措施，可取得较好的防治效果。
在田间发现零星病株时，应立即拔除烧毁，并向病穴内撒施生石灰粉或草木灰，或向病穴内灌注2%福尔马林液或20%石灰水消毒。采收结束后，及时清除病残株，集中烧毁。在药剂选择上，番茄青枯病发病初期可选用72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂4000倍液，或25%络氨铜水剂500倍液、或77%可杀得可湿性微粒粉剂4000倍液，或50％琥胶肥酸铜(DT)可湿性粉剂400倍液灌根，每株灌0.3～0.5升，7～10天灌一次，交替使用不同药剂，连灌3～4次，防治效果较好。
