双孢菇是一种中温型食用菌，出菇管理应掌握五个要点。
一、水分管理
出菇后土层喷水的原则应掌握菇多时多喷，菇少时少喷；前期多喷，后期少喷；晴天干燥多喷，阴雨天气少喷或不喷；土层较厚间歇喷重水，土层较薄，多次轻喷水；干处多喷，湿处少喷。
二、温度管理
出菇的适宜温度为16℃-18℃。出菇前期，由于气温偏高，可利用晚上通风降低菇房内的温度。出菇后期，气温偏低，可利用中午通风以免大幅度降低菇房内的温度。
三、湿度管理
菇房内的空气相对湿度应根据情况灵活掌握。秋菇前期温度高，水分蒸发快，菇多，需水量大，菇房内的湿度应保持在90%-95%，每天应在地面走道的空间、四周墙壁、草帘上喷雾浇水2-3次。当每次采收高峰过后，菇房空气相对湿度适当降低，空中、地面不再喷水，并适当加大通风，以促进菌丝的生长和提高结菇能力。
四、通风换气
在出菇阶段需氧量较大，菇房内须经常保持空气新鲜。温度高时，通风需考虑到既能降低菇房内的温度，又要保持菇房内的湿度；而温度低时，通风既要考虑不降低菇房内的温度，并保持菇房内的湿度。
五、挑根补土
每次采菇后，应及时用镊子挑除遗留在床面上干瘪、变黄的老根和死菇，然后用湿润的细土及时将带走的泥土补上。
