免疫程序是否科学、合理是决定养鸡场饲养成败的决定性因素之一，因此在制定免疫程序时一定要严谨、慎重，笔者认为在制定时应考虑以下因素：
疫病流行情况养鸡场在制定免疫程序时首先应考虑当地疫病流行情况，一般而言，免疫的疫病种类主要是可能在该地区暴发、流行的疫病。
鸡群抗体水平鸡体内存在的抗体依据来源可分为两大类：一类是先天所得，另一类是通过后天免疫产生。鸡体内的抗体水平与免疫效果有直接关系。在鸡体内，抗体会中和接种的疫苗，因此在鸡体内抗体水平过高或过低时接种疫苗，效果往往不理想。免疫应选在抗体水平到达临界线时进行。
疾病种类有的疾病对各日龄的鸡都有致病性，而有的疾病只危害某一生长阶段的鸡，如新城疫、传染性支气管炎，各种年龄的鸡都易感，而减蛋综合征只危及产蛋高峰期的蛋鸡，法氏囊病主要危及青年鸡等。因此应在不同生产年龄进行不同的免疫，而且免疫时间应设计在本场发病高峰期前1周，这样既可减少不必要的免疫次数，又可把不同疾病的免疫时间分隔开，避免了同时接种疫苗所导致的干扰及免疫应激。
生产需要根据生产需要可将鸡分为肉鸡与蛋（种）鸡两大类。两者的免疫程序在同一疾病流行区是不同的。蛋（种）鸡的生产周期较长，一次免疫不足以提供长效的免疫力，因此需进行多次免疫，且疫苗种类还应加上危及产蛋率、孵化率的疫苗。蛋（种）鸡免疫后还应保证其孵出的雏鸡含有较高水平的母源抗体。肉鸡由于生产周期较短，因此免疫次数及疫苗种类皆比蛋（种）鸡少。
饲养管理水平在不同的饲养管理方式下，传染病发生的情况及免疫程序的实施情况有所差异。在先进的饲养管理方式下，养鸡场一般不易受强毒的攻击，且免疫程序实施较为彻底；在落后的饲养管理水平下，鸡与各种传染病接触的机会较多，免疫程序不一定得到彻底落实，此时免疫程序设计就应考虑周全，以使免疫程序更好地发挥作用。一般而言，饲养管理水平低的养鸡场，其免疫程序比饲养管理水平高的养鸡场复杂。
疫苗种类设计免疫程序时应考虑用合理的免疫途径、疫苗类型来刺激鸡产生免疫力。活疫苗一般是减毒苗，可在体内繁殖，因此可提供强而持久的免疫力，但是活疫苗未完全丧失感染力，有的活疫苗自身容易产生突变。肉鸡多用毒力较弱的疫苗以预防气囊炎，而蛋鸡或母源抗体较高的鸡群可用中等毒力疫苗。由于活疫苗之间存在相互干扰，故一般活疫苗不用联苗。建议各养鸡场选择正规厂家提供的弱毒疫苗（最好是单苗）进行基础免疫，选用灭活苗进行加强免疫（在发病严重地区用单苗，在安全地区可选用联苗）。对于一些血清型变异较大的疾病，可选用地方毒株制备灭活疫苗进行加强免疫。
免疫方法正规疫苗生产厂家提供的产品均附有使用说明，免疫应根据使用说明进行。一般活疫苗采用饮水、喷雾、滴鼻、点眼、注射免疫，灭活苗则需肌肉或皮下注射。合适的免疫途径可以刺激鸡尽快产生免疫力，不合适的免疫途径则可能导致免疫失败，如油乳剂灭活苗不能做饮水、喷雾，否则易造成严重的呼吸道或消化道障碍。同一种疫苗用不同的免疫途径所获得的免疫效果也不一样，如新城疫，滴鼻、点眼的免疫效果比饮水好。
免疫效果一个免疫程序应用一段时间后，效果可能变差，此时可根据免疫效果结合免疫监测情况适当调整免疫程序。
