菌核病是果桑上的重要病害之一，由真菌侵染引起。被害桑果肥大，呈乳白色或灰白色，捻破后可闻到发酵的腐臭味，病果中心有一块黑色干硬的菌核。病菌菌核在土中越冬，次年桑树开花时菌核抽出子囊盘，子囊盘上生出子囊和子囊孢子，子囊孢子随风传播侵入花器，多在果实成熟前发病。桑园通风透光条件差，果桑开花期遇连续阴雨天气、结实期气温偏高，菌核病发生重。
防治果桑菌核病，应改善桑园通风透光条件，并在初花期至盛花期，用农药70%甲基硫菌灵可湿性粉剂1000倍液或50%多菌灵可湿性粉剂600～1000倍液喷雾预防，每隔7天一次，连续防治2～3次，采果前15～20天停用。已发病的果桑每隔4天用一次药，直至少量桑果由青变红时停药。病果应及时摘除，并带出桑园烧毁或深埋。冬季桑树处于休眠期时，用4~5波美度石硫合剂涂刷桑树枝干，对菌核病有较好的预防作用。
