随着秋椒的大面积种植，加之秋椒定植期正值夏季高温、多雨季节，青椒苗蕾期疫病发生严重，部分农户甚至毁苗毁棚，损失惨重。
长期以来，药剂防治青椒疫病一直以喷雾的方法为主，但由于疫病发生病程短、蔓延快，往往单独药剂喷雾的方法很难奏效，大面积防治效果并不理想。为此，近几年来通过选用对路药剂，根据栽培方式、发生传播途径不同，采用药剂浇根预防、发病后喷淋根部的方法，对预防和控制青椒疫病效果较好。其技术如下。
春椒疫病的发生主要在青椒生长的中后期。沿海地区主要有两个发病高峰：
一是发生在4~5月份，发生原因主要是由于抗旱不当引起，特别是浇水将泥土飞溅到植株上引起发病。
二是春椒疫病主要发生在夏秋高温雨季期间，田间排水不畅、地面有积水，加快病菌侵入。田间发生特点有明显的发病中心，病状以青椒茎秆、分枝呈黑色，导致植株萎蔫，有的果实腐烂。防治方法要在避免大水漫灌和得当的抗旱方法的基础上，采用69%烯酰锰锌600倍或35%烯酰霜脲氰800倍喷雾，同时对发病中心用同样的药剂喷淋地面封锁，药剂防治方法同上。通过防治方法的改进，一般比单独喷雾防效提高30%以上。
