植物源农药有很多的优点，但是有利必有弊，它同样有很多的缺点：
植物源农药有如下突出的优点：一、由于它们所含的有效成分为天然物质，而不是人工合成的化学物质，施用后在自然界有其顺畅的降解途径，对环境无污染或污染小；二、由于植物杀虫剂杀虫成分较多、作用方式独特，使害虫较难产生抗药性；三、它们一般具有选择性强，对人、畜及天敌毒性低，开发和使用成本相对较低的特点。
植物源农药的缺点，如多数天然产物化合物结构复杂，不易合成或合成成本太高；活性成分易分解，制剂成分复杂，不易标准化；大多数植物源农药发挥药效慢，导致有些农民朋友认为所使用的农药没有效果；喷药次数多，残效期短，不易为农民接受；由于植物的分布存在地域性，在加工场地的选择上受到的限制因素多；植物的采集具有季节性等。
