杀菌剂的使用是防治农作物病害的有效措施。杀菌剂对病原菌的作用表现为杀菌作用和抑菌作用两种方式。
杀菌作用主要是杀菌剂真正把病原菌杀死，从中毒表现来看，主要是孢子不萌发，不能侵入农作物体内。抑菌作用是杀菌剂抑制病原菌生命活动的某一过程，如抑制菌丝生长、抑制病原菌产生细胞、抑制病原菌有丝分裂、抑制病原菌细胞壁的形成等，使之不能发展，并非将病原菌杀死；在受抑制的一定时间内失去致病能力，而作物继续生长，当药剂被洗除或分解后，病原菌仍能恢复生命。杀菌剂两种作用方式的表现，除与药剂性能有关外，还与药剂使用浓度和作用时间长短有关，同一种药剂因使用浓度和作用时间不同，很可能表现为不同的作用方式。
在生产中施用杀菌剂后，对作物表现出保护、治疗和铲除作用。
