僵界
发生原因。用激素处理花朵的时间把握得不准或激素浓度过大；夜温太低，造成营养物质积累太少。激素处理花朵最佳时间只有3天，即花朵开放当天和开放前2天，在这3天后处理无效，提前处理易形成僵果。
防治对策。棚室番茄开花期应注意保温；合理使用坐果灵等激素，浓度一般要求为0．003％，但应灵活处理，即气温高时浓度低点，气温低时浓度高点；均衡果实营养供应等。
落花
发生原因。早春雨雪天气多；棚室盖苫早、揭苫晚造成弱光条件，植株光合作用差，易形成较多的短花柱而导致落花；用激素处理效果不佳。
防治对策。晴天时，草苫应早揭晚盖，延长光照时间，阴天也应揭苫吸收散射光，阴雨天可缩短揭苫时间，但不能不揭；日光温室后墙挂反光幕，拱式大棚地面铺反光膜；晚上用日光灯补光；定期喷施强力光合灵等。
畸形果
发生原因。常见的有果实上长有瘤状突起的瘤状果、形状不圆的变形果（尖嘴果、椭园形果）等，主要是花芽分化时低温引起花芽分化异常造成。此外，生长激素浓度过高，也易造成尖嘴果；土壤供水不匀影响花芽发育也可形成畸形果。
防治对策。在花芽分化的苗期，创造良好的温度、光照、肥水条件，保证花芽分化正常。此外，生长激素如2，4-D、番茄灵或萘乙酸，应用浓度要适当，这样可避免畸形果的发生。
空洞果
发生原因。果皮与胎座组织分离，种子腔成为空洞，果肉少，味淡，影响果实品质与重量。原因主要有三个：一是花芽形成期和开花授粉期遇低温或光照不足，导致授粉不良种子退化；二是氮肥施用过多，营养生长过旺，或施用生长激素后，果实膨大期养分不足；三是利用激素不当，2，4-D或番茄灵浓度过大或使用时间过早，花蕾太小。
防治对策。在番茄花芽形成期和开花授粉期应防止棚温过低；加强光照，合理补充磷、钾肥；激素应在开花当天或开花前1～2天使用。
植株生长过弱或过旺
发生原因。生长过弱的植株由于营养物质少，花梗细，花瘦小，花柱短，易落花；生长过旺的植株由于叶片制造的养分被茎叶争夺，所开的花也易落。以上两种植株所开的花即使使用激素处理，也会形成僵果或畸形果。
防治对策。定植时淘汰弱小苗和僵苗，选壮苗。增施肥料，促根壮秧，根据植株生长情况，实行限果管理。对营养生长过旺的植株，前期适时蹲苗，蹲苗期适当控水控肥，中耕松土，控制营养生长，促进生殖生长。
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