荞麦黑斑病属半知菌亚门真菌，主要为害叶片。初期病斑褐色，有轮纹，病菌以菌丝体和分生孢子在病残体上或随病残体遗落土中越冬，翌年产生分生孢子进行初侵染和再侵染。一般成熟老叶易染病，雨季或管理粗放、植株长势差，利于该病扩展。东北9月发生，长江以南6月可见。【防治措施】
1、选用抗病品种，播种前用种子重量0.5%—1%的细硫磺粉加新高脂膜500倍液拌种，能驱避地下病虫，隔离病毒感染，不影响萌发吸胀功能，加强呼吸强度，提高种子发芽率。
2、因地制宜适时早播，把地整平，提高播种质量，并在荞麦生长期及时用磷酸二氢钾，或硼、钼、锰等微量元素进行根外追肥，提高植株抗病能力，同时在荞麦孕穗期喷施壮穗灵提高授粉质量，增加千粒重，提高亩产量。
3、药剂防治，发病初期应根据植保要求喷施75％百菌清可湿性粉剂600倍液、50％扑海因可湿性粉剂1000倍液、70％代森锰锌可湿性粉剂500倍液等药剂防治，隔7～15天1次，防治2～3次，同时喷施新高脂膜800倍液提高药剂有效成分利用率，巩固防治效果。
