1、加强大田管理
一是起垄移栽
规范起垄、理沟排水可有效防止田间积水，减少积水造成的沤根，同时可减少田间流水和烟株基部接触，避免病原物通过流水交叉感染，还可降低田间湿度，制造不利于病原物繁衍的环境，降低病害发生几率。
二是合理施肥
根据土壤肥力及有机质含量高低确定施肥量，配合施用氮、磷、钾肥，增施腐熟有机肥，重施底肥，追肥应多次施用，但每次施用的量不宜过多。施肥次数及施肥量应坚持“缺什么补什么，缺多少补多少”的原则，避免盲目施肥和施入未经腐熟的有机肥。
三是及时中耕培土
移栽后要及时中耕培土，剔除田间杂草，疏松土壤，增加土壤透气性，易板结土壤应多次中耕培土。中耕培土时应避免粗暴管理，避免造成人为机械损伤。
四是强化病株管理
田间管理时应遵循“先健株、后病株”原则，避免病株与健株间人为交叉感染；重病株经防治无法恢复正常生长的应及时带根带土清除，避免病株残体及周围杂草、土壤落入其余正常植株周围，减少田间病原物数量，病株周围用生石灰消毒；清除的感病植株应选择地势低洼和远离水源地区集中销毁，避免病原菌通过水流进入其他田块。
2、防治地下害虫
冬闲田深翻耕，利用冬季低温冻死部分越冬害虫；地下害虫重的地区可于施入底肥时混入农药一同施入，杀死地下害虫；移栽当天及时喷施农药，防止地下害虫取食咬断或咬伤茎杆。
3、加强病害防治
病害防治应遵循“预防为主，综合防治”的植保方针，以农业防治为主，化学防治为辅，切实采取各种措施，最大限度地降低病害发生率。
一是选择抗病品种
选择抗病品种是预防生物病害的较为经济有效的措施，也是无公害烟草栽培的重要手段，但抗病品种的抗病性是相对的，没有一个品种对所有病害都有较强抵抗力。因此，应根据当地的生态条件以及各种病害的流行发生程度，选择最适宜的品种种植。
二是合理轮作
与禾本科作物或甘薯轮作3年以上，或水旱轮作，避免轮作期间种植番茄、辣椒、马铃薯等茄科作物，降低土壤中病原菌的数量。
三是培育无病壮苗
无病壮苗是大田生产丰收的基础，全面推行漂浮育苗，加强苗期统一管理，培育无病壮苗，增强植株抵抗力，可有效避免苗期病害的发生和带病进入大田。
四是早栽早管
选用无病壮苗，适时提前大田移栽时间，使烟株易感病阶段错开高温多雨季节，加强田间管理，及时中耕培土，增施钾肥和腐熟有机肥，增强烟株长势，提高抵抗力。
五是化学防治
田间发现感病植株后应及时诊断病害种类，针对不同病害种类选择相应药剂进行防治。防治病害的药剂应经常更换，避免重复使用产生抗性。
在黑胫病防治上，移栽时用1500倍液移栽灵浸泡苗盘5min或用58%甲霜灵锰锌500倍液均匀喷雾，使药剂充分进入基质，再带药移栽。田间发现有植株患病时，用50%烯酰吗啉可湿性粉剂1500倍液、72%甲霜灵锰锌800倍液、72.2%霜霉威水剂900倍液或25%加霜锰锌可湿性粉剂800倍液，采取喷淋茎基部的方式灌根，喷淋范围为病株周围2～3m，连续施用2～3次。
在青枯病防治上，往年发病重的田块，可于翻耕时根据发病程度施入一定量的生石灰进行消毒；发病初期，用200U农用链霉素溶液或3000亿个/g荧光假单胞菌粉剂灌根，或用20%青枯净1000～1500倍液整株喷雾。每15d防治1次，连续施2～3次。在根黑腐病防治上，发病初期，可喷施75%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500～800倍液灌根。也可用50%福美双可湿性粉剂0.5kg与500kg细土混合均匀，移栽时穴施。
