黑点病
黑点病为盾座菌科之病原菌Diplocarponrosae所引起，是玫瑰栽培最常见之病害，在高温多湿时期发病最严重。发生于叶、叶柄和茎部，植株受感染时，叶片出现黑色圆形病斑，尤其以接近地面之成熟叶片受害最多，罹病叶片会逐渐黄化而脱落，发病严重时，全株大部分叶片脱落，无法行光合作用，造成生育不良。
防治玫瑰黑点病首要之务在于保持栽培环境的卫生，例如：清理病叶，以防止真菌孢子再散布；尽量在早晨浇水，使叶片保持干燥，病原菌较不易繁衍散布。其次，注重修剪避免枝叶丛集，保持植株通风良好。可利用药剂防治，如以免赖得（亿力）1000倍喷洒全株，每隔5~7天施用一回，连续施用3~5回，还可兼治锈病和白粉病。
白粉病
玫瑰白粉病属于真菌性病害，由病原菌Sphaerothecapannosa所引起。主要感染幼叶、嫩茎和花蕾等部位，其感染部位会出现白色粉状病斑；严重感染时叶片会变脆、萎缩卷曲而干枯。
白粉病发病时期与黑点病不同，当气温较低而相对湿度较高时，白粉病的发生较严重，通常在冬季时发生最多。一般而言，气候潮湿、通风不良及日照不足下最容易发病，因此冬季栽培玫瑰必须防治白粉病，才能使玫瑰生育良好。防治玫瑰白粉病也和黑点病一样，必须注意修剪，以保持植株通风良好，并且避免在光照不足的地方栽种玫瑰，或与其它容易感染白粉病的植物隔离，如：百日草、大理花等。选择抗病性品种可减少白粉病的威胁，或利用免赖得（亿力）1000倍喷洒全株。
根头癌肿病
由土壤细菌性病原菌Agrobacteriumtumefaciens所引起，主要侵害茎部和根部，常发生于植株与土壤接触的部位，受感染的部位肿大形成瘤状物而环绕茎部，使植株生育不良而至死亡。
由于根瘤病感染植株之后很难治疗，因此最好一发现罹病植株必须马上拔除烧毁，并且利用土壤消毒剂消毒植穴后才可种植。预防根瘤病主要在于购苗时小心选购，于种植前后避免在茎部造成伤口，尤其在靠近土壤的部位。另外，不宜使用感病株附近之土壤覆土，以免感染。
枝枯病
枝枯病又为溃疡病，为真菌性病原菌所引起，经由伤口进入植株，使茎部全部或部分坏死，进而往上或往下坏死，使患部上位之枝叶生长不良或枯死。玫瑰的伤口主要是由于修剪所造成，此外低温寒害或者嫁接等操作也会造成伤口，而枝枯病亦能从茎部刺剥落处进入。一般枝枯病在节间较易发生，所以修剪时应尽量使伤口靠近节的位置，可预防发生枝枯病。另外大轮种的玫瑰、植株营养不良或感染黑点病，皆较容易受感染。
防治玫瑰枝枯病，随时要将罹病的枝条切除并烧毁，因为病原菌会产生孢子在枝条上过冬，所以必须保持田间卫生。修剪病株前后要利用70%酒精或10%的漂白水消毒工具，修剪时伤口要靠近节的部位，并呈45角度可避免病原菌进入伤口。
