干细胞是一类具有自我复制能力的未充分分化、尚不成熟的多潜能细胞，有自我更新和分化潜能，医学界称为“万能细胞”。在一定条件下，它可以分化成多种功能细胞，形成任何类型的组织和器官，以实现机体内部建构和自我康复。干细胞治疗疾病目前已经进入一个崭新的时期，很多疑难杂症通过干细胞治疗都达到了缓解症状的目的，为患者带来了福音。
至今，干细胞治疗尚未发现严重的副作用及可能出现的风险，与常规治疗和标准的手术相似。干细胞治疗现阶段被医疗界广泛使用，最适宜干细胞移植的疾病有以下几种：
糖尿病：干细胞移植治疗糖尿病已经具备应用于临床的前景。干细胞治疗一方面可以对患者的胰岛功能进行恢复；另一方面可以对胰岛素抵抗进行调整，从而达到治疗的目的。一旦治疗成功则有望摆脱药物。
糖尿病足：糖尿病足是糖尿病的难治性继发疾病，患者在晚期往往面临着截趾、截足、截肢的悲惨结局。来源于骨髓或外周血的内皮祖细胞能够在血管损伤部位分化形成新生血管，进而改善肢体血供。由于这种细胞治疗的干细胞取自患者本人，因此不存在免疫排斥及胚胎干细胞所涉及的伦理问题。
脑外伤后遗症：干细胞移植可以治疗脑外伤后遗症患者，是因为干细胞分化后产生神经元和胶质细胞可以分泌多种神经营养因子，改善脑局部微环境并启动再生相关因素顺序表达，使损伤轴突开始再生。它们同时产生多种细胞外基质，填充脑损伤遗留的空腔，为再生的轴突提供自持物；补充外伤后缺失的神经元和胶质细胞；使残存脱髓鞘的神经纤维和新生神经纤维形成新的髓鞘，保持神经纤维功能的完整性。再辅以系统的康复锻炼，促进移植的神经干细胞生长和修复，大大减少了后遗症的发生或改善了后遗症的状况，改善了病人的生活质量。
脑瘫：神经干细胞移植后分化的神经元补充缺损的神经元，并促进小儿脑组织中的神经干细胞分化发挥功能，恢复脑神经的正常生长发育，改善大脑认知功能障碍，为脑瘫小儿进一步康复提供了更多的机会。并且年龄越小，代偿能力越强，治疗的可能性就越大。
脑出血：神经干细胞移植为脑血管后遗症的治疗开辟了一条新的途径，使患者的神经功能得以更好的恢复和改善。干细胞移植后分化成神经元以替代局部已受损的神经细胞，且能分泌多种神经营养因子和神经生长因子保护神经元残存的功能，及时改善病变脑组织的功能，使患者的神经功能得以恢复和改善。
脑萎缩：目前因为脑萎缩的病因不清，药物治疗不好。随着干细胞技术的发展，干细胞已成为治疗萎缩的有效方法。
脊髓损伤：脊髓损伤后移植的神经干细胞能向损伤处迁移，且存活和增殖，分化为神经元或星形胶质细胞、少突胶质细胞，使神经细胞轴突与髓鞘再生，建立正确的和功能性的突触连接；并使残存脱髓鞘的神经纤维和新生的神经纤维形成新的髓鞘，保持神经纤维功能的完整性，恢复受损神经功能。
股骨头坏死：骨髓间充质干细胞治疗股骨头坏死，是我们从胚胎时期就保留在骨髓腔内的原始干细胞，成年后不断补充新陈代谢死亡的各种细胞。骨髓间充质干细胞可以在人为控制下长出大量的毛细动静脉血管网和新生骨组织。因此我们可以应用骨髓间充质干细胞的移植，从根本上解决股骨头缺血坏死的血供问题。
