辣椒苜蓿花叶病毒病可侵染菜豆、豇豆、蚕豆、茄子、烟草等，但不侵染番茄。甜椒和耐湿辣椒染病后，初在叶上产生褪绿斑点和环斑，大小1～2毫米，暗褐色，后叶坏死；上位叶产生系统褪绿环斑或黄色斑驳，多沿脉扩展，心叶变小，稍扭曲、畸形；湿度大条件下，叶脉或茎部产生坏死条纹，果实上也生褪绿花斑，植株稍黄化，矮缩。
一、发病规律
1.病毒病是高温干燥的产物，在越夏、秋延迟初期发病严重。
2.病毒体是结构简单的蛋白质体，如果植株在不造成伤口的前提下，病原体很难穿透细胞壁而侵入植株体内。伤口是植株生长期病毒病的主要传播途径，主要有以下几种方式造成伤口：害虫噬咬，田间操作，叶片摩擦等。
3.不同品种之间的抗性差异很大。要根据不同生长时期的气候特点选择相应的甜椒品种。
4.传播途径较广。棚外杂草、田间害虫(特别是白粉虱)都可以携带病原菌。
二、防治措施
农业防治
①选用抗病品种 羊角形或牛角形品种比灯笼形品种抗病 抗耐病品种有保加利亚辣椒、中椒2号、中椒4号、中椒5号、农大40、甜杂2号、早丰1号、苏椒2号、双丰、洛椒1号、鲁椒1号、鲁椒3号、早杂2号、湘研1号、辽椒4号、辽椒3号、沈椒2号、茄门、吉林3号、7604、向阳椒、巴彦椒等。
②种子消毒 一般要用10%磷酸三钠溶液浸泡种子20分钟，然后再催芽、播种。
④加强田间管理 最好与大田作物实行2～3年轮作。深耕深翻，每667平方米施优质腐熟有机肥5000千克作基肥，还要及时追肥，提高植株抗病能力。采用高畦、双行密植法，覆盖地膜，以促进辣椒根系发育。
未覆盖地膜者，生长前期要多中耕，少浇水，以提高地温，增强植株抗性。夏季高温干旱，傍晚浇水，降低地温。雨季及时排水，防止地面积水，以保护根系。注意防治蚜虫。避免农事操作传毒，在进行整枝、绑蔓、喷花等农事操作时，对病、健株分开操作，避免传毒。
